Skip to main content

Table 3 Splice-leader isoforms isolated in two chætognath species: S. cephaloptera and F. enflata

From: Chætognath transcriptome reveals ancestral and unique features among bilaterians

Form

ID

Sequence

Species

Abundance

Form 1

SL1

GGAAGCTAAAATTCTTTTA--TTTGCTT-AATTAAA

Both

<

Form 2

SL2.0

GGAAGCTTATAATTGAGTAGTTTCAATTTGTTTAAA

Both

70.83%

 

SL2.1

GGAAGCTTATAATTGAGTGGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.2

GGAAGCTTATAATTGAGCAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.3

GGAAGCTTATAATTGACTATTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.4

GGAAGCTTATAATTGAGTATTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

1.44%

 

SL2.5

GGAAGCTTATAATTGCGTATTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.6

GGAAGCTTATAATTGCGTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.7

GGAAGCTTATAATTCATTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.8

GGAAGCTTATAATTCAGTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.9

GGAAGCTTATAATTGATTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

2.17%

 

SL2.10

GGAAGCTTATAACTGTTTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.11

GGAAGCTTATAATTGACTAGTTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL2.12

GGAAGCTTATAATTGAGTAGCTTCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

Form 3

SL3.1

GGAAGCCAAT-TTCTACTA-CTTCACTT-GTTTAAA

F. enflata

-

 

SL3.2

GGAAGCTAAT-TTCTACTA-CTTCACTT-GTTTAAA

F. enflata

-

 

SL3.3

GGAAGCTAAT-ATCTACTA-CTTCACTTTGTTTAAA

F. enflata

-

Form 4

SL4.1

GGAAGCTTATTATCAAGTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.2

GGAAGCTTATTATTAAGTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

16.91%

 

SL4.3

GGAAGCTTATTATTAAGTACTACCAAATTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.4

GGAAGCTTATTATTAAGTACTACCAGTTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.5

GGAAGCTTATTATTACGTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.6

GGAAGCTTATTATTAATTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.7

GGAAGCTTATTATTATTTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.8

GGAAGCTTATTATTAACTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

 

SL4.9

GGAAGCTTATTATTCAGTACTACCAATTTGTTTAAA

S. cephaloptera

<

  1. The abundance of the forms corresponds to the rate of the forms among all SLs and is calculated only for S. cephaloptera sequences. A 'less-than' sign indicates that the abundance is below 1%.