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Table 2 Results for 14 previously studied organisms

From: RASTA-Bacteria: a web-based tool for identifying toxin-antitoxin loci in prokaryotes

Organism

ccdAB

higBA

mazEF

parDE

phd/doc

relBE

vapBC

hipBA

Unclass.

Total

Aquifex aeolicus VF5*

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

1 (0)

6 (2)

2 (0)

0

9 (2)

A. tumefaciens str. C58*

0 (0)

0 (0)

1 (1)

3 (3)

1 (0)

7 (7)

5 (3)

6 (0)

1

24 (14)

Bacillus anthracis Ames

0 (0)

0 (0)

1 (1)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

1 (1)

Bacillus subtilis

0 (0)

0 (0)

1 (1)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

1 (1)

Bradyrhizobium japonicum

0 (0)

4 (4)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

1 (1)

6 (0)

0

12 (5)

Borrelia afzelii Pko

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Buchnera aphidicola str.

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Campylobacter jejuni

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

1 (0)

1 (0)

0 (0)

0

2 (0)

C. pneumoniae CWL029

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Coxiella burnetii RSA 493*

0 (0)

3 (3)

0 (0)

1 (1)

0 (0)

1 (1)

2 (2)

0 (0)

3

10 (7)

Escherichia coli K12

0 (0)

1 (1)

2 (2)

0 (0)

0 (0)

4 (3)

2 (0)

0 (0)

0

10 (6)

Haemophilus ducreyi

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Lactococcus lactis

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

1 (0)

6

7 (0)

Mycobacterium leprae TN

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Mycoplasma genitalium

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Nitrosomonas europaea

1 (1)

8 (7)

5 (5)

6 (6)

2 (2)

10 (10)

20 (14)

1 (0)

4

57 (45)

Prochlorococcus marinus

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Pseudomonas aeruginosa

0 (0)

5 (1)

0 (0)

1 (1)

1 (0)

1 (1)

0 (0)

2 (0)

3

13 (3)

Rickettsia prowazekii

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0

0 (0)

Sinorhizobium meliloti*

0 (0)

6 (3)

1 (0)

8 (0)

3 (0)

2 (2)

27 (7)

1 (0)

5

53 (12)

Sulfolobus tokodaii

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

3 (3)

4 (4)

29 (25)

1 (0)

0

37 (32)

Thermotoga maritima

0 (0)

0 (1)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

1 (0)

0 (0)

0 (0)

0

2 (1)

  1. Numbers stand for TA systems (singleton or doublet) as predicted by: RASTA-Bacteria (numbers in parentheses are as predicted by Pandey et al. [39]). *Plasmids were not included in the analysis by Pandey et al. [39]. Unclass., unclassified.